Bismillah...

"Nun, demi pena dan apa yang mereka tulis...[Al Qalam 68:1]"

Bagi kebanyakan mahasiswa PhD, menulis hasil riset di jurnal internasional yang berbentuk makalah, atau biasa disebut research paper, adalah sebuah keharusan. Menulis paper berarti juga melaporkan riset yang telah dilakukan kepada seluruh dunia. Alhamdulillah, di tahun ke-2 PhD, paper pertama diterima di journal Carbon.


Perjalanan penulisan research paper ini cukup lama, sekitar 9 bulan, dari pembuatan draft sampai diterima dan dipublish. Alhamdulillahnya adalah manuscriptnya hanya perlu submit di satu jurnal, tidak perlu berganti-ganti jurnal yang dituju. Ceritanya akan lain, jika ternyata ditolak di jurnal pertama dan akan jadi lebih lama lagi :)

Penulisan draft
Setelah 6 bulan melakukan riset, April 2014, Sensei (panggilan Proffesor di Jepang ed.) akhirnya menyarankan menuliskannya sebagai manuscript dan akan disubmit di jurnal Carbon. Dengan dukungan data-data lain dari mahasiswa S2 dan S1, Sensei menilai hasil risetnya sudah cukup untuk dipublish di jurnal. 
Penulisan draft ini termasuk lama, karena selain harus menulis, juga harus mengambil data baru yang akan dilengkapi di paper, sehingga pekerjaannya tidak hanya menulis, tetapi juga melakukan eksperimen. Selain itu, karena setiap minggu kami harus melakukan presentasi progress report, maka minimal setiap 2 minggu sekali, saya harus melakukan eksperimen lanjutan tentang immobilisasi biomolekul, untuk dipresentasikan.
Penulisan draft paper pertama mengikuti panduan di buku Academic Writing for Graduate Student, bisa dibaca di sini. Menurut buku tersebut, yang paling awal ditulis, untuk riset yang berbasis eksperimen, yaitu 
1. Experimental section
2. Results and discussion
3. Conclusions
4. Introduction

Karena sudah ada jurnal target, yaitu Carbon, maka format penulisan mengikuti format jurnal tersebut. Penulisan yang paling pertama yaitu bagian experimental setup. Kenapa bagian ini pertama,  karena bagian ini adalah bagian yang paling mudah ditulis, tidak perlu analisis dan diskusi. Cukup penjelasan saja. Dan saya mengikuti saran buku tersebut. Setelah bagian eksperiment selesai, maka tahap selanjutnya bagian results and discussion. Pada bagian ini, data, gambar dan grafik dibuat terlebih dahulu, sejelas dan semenarik mungkin, dan diberi penjelasan ringkas. Karena biasanya editor dan reviewer akan melihat secara sekilas dari awal sampai akhir, data dan gambar yang ada di paper. Jika menarik perhatian, maka akan dilanjutkan dengan membaca secara detail.
Setelah draft penulisan sampai bagian results and discussion selesai. Draft itu didiskusikan dengan Sensei. Apakah ada data yang kurang. Jika ada maka harus diambil kembali datanya. Sambil mengambil data yang baru, tahap penulisan juga tetap dilakukan. Bagian sisanya, yaitu conclusions dan introduction. Kenapa bagian introduction ditulis paling akhir, karena bagian ini adalah bagian yang paling sulit dan membutuhkan banyak waktu untuk menulisnya. Selain itu, di introduction ini merupakan bagian yang penting, yang menyatakan posisi riset kita ada dimana dan apa kontribusi yang kita berikan.

Submit manuscript
Setelah draft paper selesai dan formatnya sudah sesuai dengan jurnal yang dituju, maka tahap selanjutnya adalah men-submit paper tersebut. Untuk kasus saya, Sensei sendiri lah yang men-submit paper saya di akhir November. Awalnya sebenarnya tidak terlalu banyak berharap, kalau paper saya akan dibalas editor untuk direvisi. Hal ini karena pengalaman 2 teman lab saya, yang pernah direject di jurnal Carbon. Selain itu, kualitas jurnal ini cukup bagus dengan IF 6.16. 
Sekedar mengingatkan, bagi yang tidak punya format penulisan manuscript seperti jurnal Carbon ini, sebaiknya diberi nomor baris dan halaman, supaya reviewer mudah melakukan penunjukkan baris mana dan halaman berapa di manuscript yang kita buat. Seperti contoh gambar berikut.




Revisi manuscript
Pada akhir Desember, ternyata kami dapat email balasan dari Editor in Chief jurnal Carbon, Prof. Robert H Hurt, untuk merevisi manuscript kami dalam waktu 8 minggu. Revisinya termasuk major revisi. Dari 3 reviewer, satu orang menyatakan dapat diterima dengan revisi dan dua orang reviewer lainnya menyatakan riset yang menarik namun masih harus dikonfirmasi lagi dan meminta penjelasan lebih rinci. Total komentar yang harus ditanggapi dari ketiga reviewer cukup banyak yaitu ada 30 komentar.
Untuk merevisi manuscript dan menanggapi komentar yang banyak tersebut, waktu 8 minggu harus dioptimalkan semaksimal mungkin. Saya menyiasatinya dengan membuang hal-hal yang selama ini banyak menghabiskan waktu saya, yaitu men deaktifasi akun Facebook. Selain itu, saya juga menambah waktu kerja dan membuat jadwal, komentar mana yang harus dijawab minggu ini dan seterusnya. Tips optimalisasi waktu ini, saya dapat dari blog Ario Muhammad dan Cal Newport.
Seperti biasa, segala sesuatunya dimulai dengan hal yang mudah terlebih dahulu. Setiap komentar dari reviewer diberi nomor dan response dari komentar diberi warna yang berbeda. Selain itu, jika kita merujuk ke manuscript yang direvisi, sebaiknya dibubuhkan juga nomor halaman dan baris keberapa. Seperti contoh berikut. Hal ini sangat membantu reviewer, sehingga reviewer tidak perlu mencari-cari mana yang sedang diubah. Memberi warna huruf pada manuscript juga sangat dianjurkan untuk memudahkan reviewer. Di manuscript saya, saya beri warna merah untuk yang sedang direvisi.

Di minggu ke-4, hampir semua komentar terjawab dan revisi manuscript, poor gramar serta bagian introduction, juga sudah selesai. Answer sheet comment yang hampir selesai, saya berikan ke Sensei, sekaligus diskusi mengenai beberapa komentar yang sulit terjawab. Setelah diskusi, ternyata dibutuhkan data OES yang baru. Dengan waktu yang singkat, sisa 4 minggu, plus harus membuat presentasi dan poster untuk Shizuoka Symposium, ditambah dengan membantu eksperimen Visiting Professor dari India, maka pekerjaan merevisi manuscript ini jadi lebih berat. Pada minggu ke-8, sisa 1 hari, dikirimlah revisi pertama manuscript.

10 hari kemudian, datang email dari Sensei, untuk merevisi tahap kedua. Kali ini revisi minor, dari 2 orang reviewer. 1 orang reviewer lainnya telah setuju. Lama revisinya 3 minggu. Di minggu ke-3, jawaban komentar dan revisi dikirim. Kemudian, selang 1 minggu, saya dapat email dari Sensei sekitar jam 1 malam, bahwa manucript diterima di jurnal Carbon, Alhamdulillah.. Setelah itu, biasanya akan ada proof read dari journal untuk pengecekan yang terakhir kali.


Semoga bermanfaat,
Hamamatsu, 22 Jumadil Akhir 1436


ImageJ: Software untuk mengolah gambar yg free.
(Download Software)

Menghitung intensitas fluorescence
1. Setting tabel:
Analyze => Set Measurement => Pilih (1) Area (2) Integrated density (3) Mean gray value
2. Menghitung intensitas:
Intensitas = IntDen - (Area x Mean of background)

Sumber: theolb.readthedocs.org

Digitizing data / plot dari gambar


Sumber: lukemiller.org

Kalau mau menggunakan software khusus, bisa klik link berikut:
1. http://arohatgi.info/WebPlotDigitizer/
2. http://plotdigitizer.sourceforge.net/


Semoga bermanfaat
24 Jumadil Awal 1436
Bismillah...

1. Banyak Berdo'a kepada Allah

« اَللّهُمَّ إِنِّي أَعُوْذُ بِكَ أَنْ أُشْرِكَ بِكَ وَأَنَا أَعْلَمُ وَأَسْتَغْفِرُكَ لِمَا لاَ أَعْلَمُ »

“Ya Allah, aku memohon perlindungan kepada-Mu dari perbuatan menyekutukan-Mu sementara aku mengetahuinya, dan akupun memohon ampun terhadap perbuatan syirik yang tidak aku ketahui.” (Hadits Shahih riwayat Ahmad)

2. Menyembunyikan Amal Kebaikan
Amal kebaikan yang dilakukan tanpa diketahui orang lain (seperti shalat sunnah, puasa sunnah, dan lain-lain) lebih diharapkan amal tersebut ikhlas, karena tidak ada yang mendorongnya untuk melakukan hal tersebut kecuali hanya karena Allah semata.

3. Takut Akan Tidak Diterimanya Amal

Allah berfirman:

وَالَّذِينَ يُؤْتُونَ مَا آتَوْا وَقُلُوبُهُمْ وَجِلَةٌ أَنَّهُمْ إِلَى رَبِّهِمْ رَاجِعُونَ

“Dan orang-orang yang memberikan apa yang telah mereka berikan, dengan hati yang takut, (karena mereka tahu bahwa) Sesungguhnya mereka akan kembali kepada Tuhan mereka.” (QS. Al Mu’minun: 60)

Pada ayat ini Allah menjelaskan bahwa di antara sifat-sifat orang mukmin adalah mereka yang memberikan suatu pemberian, namun mereka takut akan tidak diterimanya amal perbuatan mereka tersebut ( Tafsir Ibnu Katsir ).

Hal semakna juga telah dijelaskan oleh Rasulullah shallallahu alaihi wa sallam yang diriwayatkan dari Aisyah ketika beliau bertanya kepada Rasulullah tentang makna ayat di atas. Ummul Mukminin Aisyah berkata, “Wahai Rasulullah apakah yang dimaksud dengan ayat, “Dan orang-orang yang memberikan apa yang telah mereka berikan, dengan hati yang takut, (karena mereka tahu bahwa) Sesungguhnya mereka akan kembali kepada Tuhan mereka” adalah orang yang mencuri, berzina dan meminum khamr kemudian ia takut terhadap Allah?. Maka Rasulullah pun menjawab: Tidak wahai putri Abu Bakar Ash Shiddiq, yang dimaksud dengan ayat itu adalah mereka yang shalat, puasa, bersedekah namun mereka takut tidak diterima oleh Allah.” (HR. Tirmidzi dengan sanad shahih )

4. Tidak Terpengaruh dengan Perkataan Manusia

Ada 4 rumus menurut KH Abdullah Gymnastiar:

  • Jangan ingin amalan diketahui orang
  • Jangan ingin amalan dilihat orang
  • Jangan ingin amalan dipuji orang
  • Jangan ingin amalan dihargai orang


Bismillah..



Ada tiga hal yang mulai ditinggalkan oleh umat Islam yaitu [1]:
1. Penanggalan Hijriah
2. Kemuliaan Hari Jumat
3. Bahasa Arab

1. Penanggalan Hijriah [2]
Penanggalan Hijriah mulai banyak dilupakan oleh umat muslim. Bahkan nama-nama dan urutan ke-12 bulan hijriah tersebut kadang masih sering lupa, jika dibandingkan dengan penanggalan Masehi. Padahal, Allah subhanahu wa ta'ala menyebutkan bulan-bulan yang berkaitan dengan ibadah, seperti puasa Ramadhan dan ibadah Haji, adalah dengan penanggalan Hijriah.

4 Bulan Haram
Sungguh Allah subhanahu wa ta'ala telah berfirman :

إِنَّ عِدَّةَ الشُّهُورِ عِنْدَ اللَّهِ اثْنَا عَشَرَ شَهْراً فِي كِتَابِ اللَّهِ يَوْمَ خَلَقَ السَّمَاوَاتِ وَالأَرْضَ مِنْهَا أَرْبَعَةٌ حُرُمٌ ذَلِكَ الدِّينُ الْقَيِّمُ فَلا تَظْلِمُوا فِيهِنَّ أَنْفُسَكُمْ

Artinya:  "Sesungguhnya bilangan bulan disisi Allah ialah dua belas bulan, dalam ketetapan Allah di waktu Dia menciptakan langit dan bumi, diantaranya ada empat bulan haram. Itulah (ketetapan) agama yang lurus, maka janganlah kalian menganiaya diri kalian dalam bulan yang empat itu." (At Taubah: 36)

Bismillah..



Banyak orang yang masih mementingkan memiliki rumah di Dunia. Bekerja siang malam untuk membayar cicilan rumah. 
Akan tetapi, masih banyak yang belum mementingkan, atau bahkan belum memikirkan bagaimana cara memiliki rumah di Surga. 
Berikut 11 cara untuk memiliki rumah di surga, yang bisa dicicil mengerjakannya dari sekarang. Jika cicilannya konsisten dan ikhlash karena Allah SWT, InsyaAllah akan disiapkan rumah di Surga,

(1) Shalat sunnah 12 rakaat dalam sehari
“Tidaklah seorang muslim melaksanakan shalat sunnah untuk Allah pada setiap harinya sebanyak 12 raka’at selain shalat fardhunya, melainkan Allah akan membangunkan baginya rumah di surga“. (HR Muslim)
Bismillah..

Shalat merupakan rukun Islam yang ke-2 dan juga tiang agama. Sehingga berusaha untuk khusyu' dalam Shalat adalah hal yang didambakan oleh setiap muslim yang beriman. 


Berikut adalah beberapa cara untuk khusyu' dalam Shalat yang dipetik dari faidah buku Sifat Shalat Nabi SAW Seakan-akan Anda Menyaksikannya: 

• Menyiapkan diri secara baik untuk Shalat;
• Mengingat kematian;
• Shalat menghadap sutrah (pembatas);
• Melihat ke tempat sujud dan tidak menoleh ke sana ke mari;
• Menyingkirkan segala sesuatu yang dapat menyibukkan hati dan pikiran di tempat Shalat;
• Thuma'ninah dalam Shalat;
• Menghayati ayat-ayat dan bacaan-bacaan dalam Shalat;
• Membaguskan suara dan bacaan dalam Shalat;
• Tidak Shalat ketika makanan dihidangkan sementara dia berselera terhadap makanan tersebut;
• Tidak Shalat ketika ingin buang hajat kecil ataupun besar;
• Tidak Shalat saat mengantuk;
• Tidak Shalat di dekat orang yang berbincang-bincang atau di dekat orang tidur;
• Berusaha tidak menguap dalam Shalat.

Sumber: buku Sifat Shalat Nabi SAW Seakan-akan Anda Menyaksikannya. Dikarang oleh Syaih Muhammad Nashirudin al-Albani. Diterbitkan oleh Darul Haq edisi terjemah. Semoga bermanfaat..
Bismillah..

Alhamdulillah, di awal tahun 2015 ini bisa memperoleh Poster Award di acara yang bertema Promotion of Global Young Researchers in Shizuoka University:
"2015 International Symposium toward the Future of Advanced Researches in Shizuoka University"
~Joint International Workshops on Advanced Nanovision Science / Advanced Green Science / Promotion of Global Young Researchers in Shizuoka University~




Dari sekitar 50 presenter, yang terdiri dari mahasiswa doktor, post-doct dan assosiate professor, akan dipilih 6 orang, yang berasal dari Research Institute of Electronic, Research Institute of Green Science and Technology, dan Graduate School of Science and Technology. Dari 6 orang tersebut, akan dipilih lagi menjadi seorang yang akan mendapatkan the most outstanding poster presentation. Hadiah utamanya adalah travel grant untuk kegiatan akademik.

Setiap poster presenter harus mempresentasikan posternya tidak lebih dari 2 menit, di depan para juri dan juga preserta yang lain. Kalau lebih dari 2 menit, maka akan ada bel yang berbunyi dan nilainya mungkin juga akan dikurangi. Untuk menyiasati hal ini, slide presentasi saya persiapkan hanya 5 slide, yang terdiri dari 3 bagian inti, dan 2 slide pembuka dan penutup.

لاَ هَوْلَ وَلاَ قُوَّتَ اِلاَّبِاللّهِ


(Tiada daya dan kekuatan kecuali dengan pertolongan Allah semata-mata)

بسم الله الرحمن الرحيم

Ilmu dalam mendidik anak secara islami sangatlah penting. Akan tetapi, belum ada sekolah khusus bagi orang tua tentang bagaimana cara mendidik anak secara islami. Sebagai orang tua, saya berusaha mengumpulkan ilmu-ilmu yang berserakan di dunia maya ini, sebagai bekal ilmu untuk mendidik anak-anakku kelak. Semoga kumpulan catatan ini bermanfaat bagi kita semua yang ingin mendidik anak secara islami. Aamiin...

###1###
Finlandia adalah salah satu negara yg sistem pendidikannya adalah yg terbaik di dunia. Namun, tahukah kita bahwa sistem yg diadopsi mereka adalah sistem pendidikan Islam yg malah banyak ditinggalkan oleh negeri-negeri berpenduduk mayoritas muslim?

Salah satu contohnya misalnya usia anak sekolah. Di Finlandia, usia anak memasuki.fase sekolah dasar adalah usia 7 tahun. Fase usia 7 tahun untuk mengenyam pendidikan formal yg mulai mengenal dengan aturan, tata tertib dan kedisiplinan adalah fase yg digagas oleh Ali bin Abi Thalib ra.

Ali bin Abi Thalib membagi sistem 'Tarbiyatul Aulad' atau pendidikan anak ke dalam 3 bagian. Pertama adalah fase 0-7 tahun dimana adalah fase anak-anak bermain. Kedua adalah fase 8-14 tahun dimana anak-anak mulaindikenalkan dan dididik mengenal hukum, aturan, kedisiplinan, keilmuan dan lainnya. Dan ketiga adalah fase 15-21 tahun saat anak menjadi pribadi yg dewasa.

Sayangnya, negara-negara berpenduduk mayoritas muslim justru banyak meninggalkan sistem penjengjangan dalam pendidikan anak. Malah sebaliknya, banyak diantaranya (sekolah dan orangtua) mengadopsi cara pendidikan barat pada masa 'Dark Age'. Sehingga, yg peroleh adalah kualitas generasi muda yg lemah.

Bahkan tak ayal, sedari dini, anak-anak dijejali dengan beban yg berat untuk belajar ini dan itu. Mulai dari belajar membaca, menulis, berhitung dan lainnya. Bahkan acapkali dijumpai anak-anak usia dini dipaksa untuk menguasai berbagai bahasa.

Hmm... Pekerjaan rumah yg cukup besar dan pelik bagi kita sebagai orangtua dan para praktisi pendidikan.

Bismillah...

Karena kebutuhan untuk membuat video di power point, akhirnya saya putuskan untuk mengconvert dari file video ke file GIF (Graphics Interchange Format), agar lebih mudah dijalankan di semua komputer. Karena kadang kalau kita menggunakan video di power point, tidak semua komputer bisa support menjalankan videonya.

Ada 2 software yang bisa digunakan dan gratis: (1) GifCam; dan (2) LICECap. Saya sudah coba dua-duanya. Dan pilihan saya jatuh ke GifCam karena lebih banyak fitur yang bisa dimodifikasi.

Untuk mendownload dan mengetahui fitur-fitur lengkap GifCam bisa dilihat langsung di web: http://blog.bahraniapps.com/gifcam/

Contoh file GIF yang berhasil dibuat menggunakan GifCam untuk presentasi aplikasi plasma surface modification




Semoga bermanfaat..

Bismillah...

Unduh jurnal gratis bisa diklik di link berikut: sci-hub.org
dengan memasukkan DOI atau nama author dan judul artikel.



Untuk buku, bisa diklik di link berikut: gen.lib.rus.ec



Semoga bermanfaat.